Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim54Q9ERP3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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