Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms