Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnft1Q9DCN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnft1Q9DCN7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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