Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms