Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rsph3bQ9DA80 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rsph3bQ9DA80 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rsph3bQ9DA80 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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