Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms