Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms