Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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