Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms