Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms