Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms