Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms