Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms