Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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