Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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