Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tsnaxip1Q99P25 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms