Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms