Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms