Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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