Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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