Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms