Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc115Q8VE99 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc115Q8VE99 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc115Q8VE99 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc115Q8VE99 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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