Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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