Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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