Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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