Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms