Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnka2ipQ8CH19 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnka2ipQ8CH19 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnka2ipQ8CH19 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnka2ipQ8CH19 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnka2ipQ8CH19 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnka2ipQ8CH19 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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