Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms