Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms