Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd9Q8BYH8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd9Q8BYH8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd9Q8BYH8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd9Q8BYH8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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