Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms