Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms