Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms