Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp8Q80U87 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp8Q80U87 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp8Q80U87 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp8Q80U87 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp8Q80U87 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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