Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv1Q704Y3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms