Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Neil2Q6R2P8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Neil2Q6R2P8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms