Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms