Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms