Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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