Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms