Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms