Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usf2Q64705 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usf2Q64705 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usf2Q64705 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usf2Q64705 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usf2Q64705 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf2Q64705 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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