Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms