Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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