Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Slc6a4Q60857 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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