Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasa3Q60790 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms