Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms