Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms