Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim41Q5NCC3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms