Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms